Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Sh3bp5lQ99LH9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp5lQ99LH9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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