Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms