Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms