Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nmd3Q99L48 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms