Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms