Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TrabdQ99JY4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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TrabdQ99JY4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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