Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms