Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlcd1Q99JT6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlcd1Q99JT6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms