Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxp3Q99JB6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms