Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms