Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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