Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok1Q922Q2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms