Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek8Q91ZR4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms