Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atpaf2Q91YY4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms