Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc3Q91W40 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms