Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI47

Abcc2, Canalicular multispecific organic anion transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc2Q8VI47 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc2Q8VI47 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc2Q8VI47 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc2Q8VI47 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc2Q8VI47 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc2Q8VI47 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc2Q8VI47 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms