Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Smg8Q8VE18 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Smg8Q8VE18 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Smg8Q8VE18 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Smg8Q8VE18 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Smg8Q8VE18 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Smg8Q8VE18 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Smg8Q8VE18 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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