Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc92Q8VDN4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc92Q8VDN4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms