Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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