Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim29Q8R2Q0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms