Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K8

Uncharacterized protein C1orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R2K8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8R2K8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8R2K8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8R2K8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8R2K8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8R2K8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8R2K8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8R2K8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8R2K8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R2K8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms