Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RorbQ8R1B8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms