Protein–RNA interactions for Protein: Q8R191

Syngr3, Synaptogyrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr3Q8R191 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr3Q8R191 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syngr3Q8R191 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr3Q8R191 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms