Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hecw1Q8K4P8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms