Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OptnQ8K3K8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms