Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms