Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms