Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms