Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scnm1Q8K136 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnm1Q8K136 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms