Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmbrd1Q8K0B2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms