Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc4a8Q8JZR6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc4a8Q8JZR6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms