Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf628Q8CJ78 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms