Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc43a2Q8CGA3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms