Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms