Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms