Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spef2Q8C9J3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms