Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms