Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rft1Q8C3B8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms