Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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