Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfrp1Q8BXL7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms