Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx1bQ8BX32 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms