Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPQ7

Sgsm1, Small G protein signaling modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm1Q8BPQ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgsm1Q8BPQ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Sgsm1Q8BPQ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm1Q8BPQ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm1Q8BPQ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm1Q8BPQ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm1Q8BPQ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm1Q8BPQ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm1Q8BPQ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm1Q8BPQ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm1Q8BPQ7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms