Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms