Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp54Q8BL06 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms