Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms