Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timm29Q8BGX2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms