Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best2Q8BGM5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms