Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Jmjd4Q8BFT6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd4Q8BFT6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms