Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TnnQ80Z71 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms