Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Kdm5bQ80Y84 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms